简介
二代测序技术在科研、医疗等领域应用广泛,而选择合适的测序仪器是确保实验顺利开展和结果可靠的关键。对于刚接触二代测序的新手而言,面对多样的仪器往往难以辨别其差异。为此,我们整理了主流二代测序仪器的核心信息,希望能帮助新手快速理清它们的区别,为项目中的仪器选择提供有效参考。
主流二代测序仪器核心参数对比表
仪器品牌 型号 | 核心测序原理 | 测序读长 范围 | 典型通量 (单词运行) | 准确率 Q30 | 主要优势 |
Illumina NovaSeq | 边合成边测序 | 100-300bp | 可高达 6Tb | ≥90% | 高通量模式下数据产出效率高,适用于大型基因组项目和多样本并行分析,数据稳定性强 |
Illumina HiSeq | 边合成边测序 | 50-300bp | 可高达 1.5Tb | ≥90% | 在中小规模项目中性价比突出,测序精度稳定,适合常规转录组、外显子组等检测 |
华大 DNBSEQ-T7 | 基于DNA纳米球和联合探针锚定聚合技术 | 50-150bp | 可高达 10Tb | ≥90% | 通量极高,单位数据成本较低,适合大规模人群队列研究、全基因组关联分析等大型项目 |
技术细节补充
测序原理影响:Illumina的边合成边测序原理,通过在DNA合成过程中加入荧光标记的核苷酸,实现对序列的读取,这种方式保证了较高的测序准确率,但在通量提升上相对受限。华大DNBSEQ技术通过DNA纳米球放大信号,减少了扩增偏差,在保证准确率的同时,能实现更高的通量。
数据质量相关:Q30是衡量测序质量的重要指标,代表碱基识别错误率低于1/1000。上述仪器均能达到较高的Q30水平,可满足大部分科研和应用需求。在实际应用中,可根据具体项目对数据质量的细微要求进行选择。
选择建议
选择建议:若您的项目是大型基因组研究,且对数据产出量要求极高,华大 DNBSEQ-T7 是优先选择;若为中小规模的精准测序项目,Illumina HiSeq能满足需求;对于需要大量高质量数据的大型科研项目,Illumina NovaSeq更为合适。
参考文献
[1]https://pdf.medicalexpo.com/pdf/illumina-inc/hiseq-3000-hiseq-4000-sequencing-systems/83632-140628.html
[2]https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/novaseq-x-plus/applications/transition.html
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